Resultados preliminares genoma cacao

MARS, USDA-ARS, And IBM Unveil Preliminary Cacao Genome Sequence Three Years Ahead Of Schedule
North America | 15 September 2010

Landmark Research Effort Will Make Findings Publicly Available for Common Good

Results to Benefit 6.5 Million Farmers Worldwide and Sustain World’s Cocoa Supply

McLean, VA –Today, Mars, Incorporated, the U.S. Department of Agriculture-Agricultural Research Service (USDA-ARS), and IBM released the preliminary findings of their breakthrough cacao genome sequence and made it available in the public domain. This is the result of a joint research endeavor to improve the cocoa growing process and represents a successful private/public partnership for the benefit of the world’s cocoa farmers, and a more sustainable world cocoa supply.

The preliminary sequencing of the cacao genome is a promising first step in advancing farmers’ ability to plant more robust, higher yielding and drought and disease-resistant trees. The results of the research will be made available to the public with permanent access via the Cacao Genome Database (www.cacaogenomedb.org) to ensure that the data remains perpetually open without patent, as well as to allow scientists to begin applying the findings immediately to crop cultivation efforts.

With approximately 6.5 million farmers depending on cocoa for their livelihoods – most of them coming from small, family-run farms, cocoa is a crucial crop for their survival and the economies of their nations. However, cocoa crops have always been plagued by serious global losses from pests and diseases, and to date, there has been very little investment in scientific research to improve the cacao tree.

“As the global leader in cocoa science, we understand the importance of not only investing in this research, but making it publicly available for all to benefit,” said Howard-Yana Shapiro, Ph.D., global head of plant science and research at Mars, Incorporated. “As a private company, Mars is in a unique position to drive and fund fundamental science that will support its long term focus and vision. Although it may not benefit the bottom line in the short term, in the long run, it will ensure mutually beneficial results for the company, cocoa farmers and tree crop production in key regions of the world.”
Decades of Mars research has led to major innovations in the areas of sustainable cocoa farming technology. The company’s latest partnership – blending Mars’ cocoa expertise, USDA-ARS’ extensive experience with other major crops and IBM’s technology – is an example of the role business can play in addressing challenging global issues.

The results of this uniquely collaborative project —which were delivered three years early due to Mars’ scientific leadership, advances in genome technology and constant real-time collaboration with key partners—mark a significant scientific milestone that is already starting to benefit millions of farmers, particularly in West Africa where more than 70 percent of the world’s cocoa crop is produced. By making the results publicly available, scientists will have access to key learnings to advance plant science, while plant breeders and farmers around the world will be able to develop cacao trees that are more sustainable, and can better fend off the environmental assaults that inflict $700 to $800 million in damages to farmers’ crops each year.

“Genome sequencing helps eliminate much of the guess-work of traditional crop cultivation,” continued Mars’ Shapiro. “Cocoa is what some researchers describe as an ‘orphan crop,’ because it has been the subject of little agricultural research compared to corn, wheat and rice. This effort, which will allow fast and accurate traditional breeding, is about applying the best of what science has to offer in taking an under-served crop and under-served population and giving them both the chance to flourish.”

"The collaboration with Mars and the USDA-ARS leverages more than a decade of IBM Research's experience in computational biology, as well as the power of the Blue Gene supercomputer," said Ajay Royyuru, senior manager, IBM Computational Biology Center. “By assembling the sequence fragments into the complete genome sequence and developing a detailed genetic map, we can help maximize the potential yield and income for cocoa farmers and catalyze future research and endeavors involving the cacao tree."

Mars was the primary funder of the project, investing millions into the research. Other partners in addition to the USDA-ARS Subtropical Horticulture Research Station in Miami, and the Jamie Whitten Research Center in Stoneville, Miss., and IBM, include: Clemson University Genomics Institute; Public Intellectual Property Resource for Agriculture at the University of California-Davis; National Center for Genome Resources; Center for Genomics and Bioinformatics at Indiana University; HudsonAlpha Institute for Biotechnology; and Washington State University. Moving forward, the collaboration will continue to analyze and characterize the cocoa genome in preparation for submission to peer-reviewed publications.
“The talent and dedication brought together through this partnership is unmatched,” concluded Shapiro. “Our work is not over, however – we have a shared responsibility to continue our research and release new information to the public as we continue on this path of discovery.”

For more information, please visit cocoasustainability.com or www.cacaogenomedb.org.





MARS, USDA-ARS, e IBM revelan Cacao preliminares secuencia del genoma de tres años de anticipación
América del Norte | 15 de septiembre 2010

Esfuerzo de investigación de referencia Hará resultados disponibles al público para el Bien Común

Los resultados a beneficio de 6,5 millones de agricultores en todo el mundo y fomentar la oferta mundial de cacao

McLean, VA-Hoy en día, Marte, incorporado, el Departamento de Agricultura de EE.UU., Servicio de Investigación Agrícola (ARS-USDA), e IBM publicó los resultados preliminares de su cacao avance secuencia del genoma y la haya publicado en el dominio público. Este es el resultado de un esfuerzo conjunto de investigación para mejorar el proceso de cultivo del cacao y representa un éxito asociación privada y pública en beneficio de los cultivadores de cacao del mundo, y un suministro mundial de cacao más sostenible.

La secuenciación del genoma preliminar de cacao es un primer paso prometedor en la promoción de 'capacidad de los agricultores a sembrar más robusto, de mayor rendimiento y resistentes a la sequía y los árboles-enfermedad. Los resultados de la investigación serán puestos a disposición del público con acceso permanente a través de la base de datos del genoma del cacao (www.cacaogenomedb.org) para asegurar que los datos permanecen perpetuamente abierta, sin patentes, así como para permitir a los científicos para comenzar a aplicar los resultados de inmediato para recortar los esfuerzos de cultivo.

Con aproximadamente 6,5 millones de agricultores en función de cacao para su sustento - la mayoría de ellos procedentes de las pequeñas explotaciones familiares de cacao, un cultivo esencial para su supervivencia y las economías de sus naciones. Sin embargo, los cultivos de cacao han sido siempre el azote de graves mundial las pérdidas por plagas y enfermedades, y hasta la fecha, ha habido muy poca inversión en investigación científica para mejorar el árbol del cacao.

"Como líder global en ciencia del cacao, entendemos la importancia de no sólo invertir en esta investigación, pero ponerla a disposición pública para que todos puedan beneficiarse", dijo Howard-Yana Shapiro, Ph.D., jefe global de la ciencia y la investigación de plantas en Marte, incorporado. "Como empresa privada, Marte está en una posición única para impulsar y financiar la ciencia fundamental que apoyará su enfoque a largo plazo y la visión. A pesar de que no podrán beneficiarse de la línea de fondo en el corto plazo, a largo plazo, se asegurará de mutuo resultados beneficiosos para la empresa, los agricultores de cacao y la producción de cultivos de árboles en regiones clave del mundo ".
Décadas de investigación de Marte ha dado lugar a innovaciones importantes en las áreas de tecnología sostenible cultivo de cacao. Reciente de la compañía de asociación - la experiencia de mezcla de Marte de cacao, la amplia experiencia del USDA-ARS, con otros cultivos importantes y la tecnología de IBM - es un ejemplo del rol que las empresas puede desempeñar para abordar problemas o retos globales.

Los resultados de este singular proyecto de colaboración, que se entregaron tres años antes debido a la dirección científica de Marte, los avances en la tecnología del genoma y constante colaboración en tiempo real con los principales socios-marca un importante hito científico que ya está empezando a beneficiar a millones de agricultores, en particular en África Occidental, donde se produce más del 70 por ciento de la cosecha de cacao del mundo. Al hacer públicos los resultados, los científicos tendrán acceso a las enseñanzas destacadas para lograr avances científicos de plantas, mientras que los fitomejoradores y agricultores de todo el mundo será capaz de desarrollar árboles de cacao que sean más sostenibles y mejor puede resistir los embates del medio ambiente que causan $ 700 a US $ 800 millones en daños a los cultivos de los agricultores cada año.

"La secuencia del genoma ayuda a eliminar gran parte de las conjeturas de los cultivos tradicionales", continuó Shapiro Marte. "El cacao es lo que algunos investigadores describen como un" cultivo huérfano ', porque ha sido objeto de la investigación agrícola poco en comparación con el maíz, el trigo y el arroz. Esta iniciativa, que permitirá tradicionales de cultivo rápido y preciso, se trata de aplicar lo mejor de lo que la ciencia tiene para ofrecer en la adopción de un cultivo menos atendidas y desatendidas de la población y dar a ambos la oportunidad de florecer. "

"La colaboración con Marte y el USDA-ARS, aprovecha más de una década de experiencia de IBM Research en biología computacional, así como la potencia de la supercomputadora Blue Gene", dijo Ajay Royyuru, gerente senior de IBM Centro de Biología Computacional. "Al reunir los fragmentos de secuencias en la secuencia completa del genoma y el desarrollo de un mapa genético detallado, podemos ayudar a maximizar el potencial de rendimiento e ingresos para los cultivadores de cacao y catalizar la investigación futura y se esfuerza por la participación del árbol del cacao".

Marte fue la principal financiadora del proyecto, invirtiendo millones en la investigación. Otros socios, además de la USDA-ARS, la Estación de Investigación de Horticultura Subtropical en Miami, y el Jamie Whitten Centro de Investigación en Stoneville, Misisipí, e IBM, son: la Universidad de Clemson Instituto de Genómica; Público de la Propiedad Intelectual de Recursos para la Agricultura de la Universidad de California- Davis, Centro Nacional de Recursos del Genoma; Centro de Genómica y Bioinformática de la Universidad de Indiana; HudsonAlpha Instituto de Biotecnología, y la Universidad Estatal de Washington. En el futuro, la colaboración continuará para analizar y caracterizar el genoma de cacao en la preparación para su presentación a publicaciones arbitradas.
"El talento y la dedicación reunió a través de esta asociación no tiene rival", concluyó Shapiro. "Nuestro trabajo no ha terminado, sin embargo - que tenemos una responsabilidad compartida para continuar nuestra investigación y divulgar información al público nuevas a medida que continuamos en este camino de descubrimiento."

Para obtener más información, visite cocoasustainability.com o www.cacaogenomedb.org.